请问，如果分公司签的合同，但是总公司没有支付工资，这种情况合法吗？

可以申请劳动仲裁，要求支付工资的
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可以申请劳动仲裁
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法律分析：单位不和员工签合同需要承担的后果是公司未与劳动者签订劳动，将依法支付双倍的工资，甚至于直接视为双方已订立无固定期限劳动合同。可以通过劳动仲裁维护合法权益，也可以向当地的劳动监察大队投诉。法律依据：《中华人民共和国劳动合同法》第十一条 用人单位未在用工的同时订立书面劳动合同，与劳动者约定的劳动报酬不明确的，新招用的劳动者的劳动报酬按照集体合同规定的标准执行；没有集体合同或者集体合同未规定的，实行同工同酬。